EXIF，或可交換圖像檔格式，是一種規定圖像、聲音，和由數位相機（包括智能手機）、掃描器和其他處理數位相機錄製的圖像和聲音檔案所使用的附屬標籤格式的標準。此格式允許元數據保存在圖像檔案本身內，並且此元數據可以包含有關照片的各種資訊，包括照片拍攝的日期和時間、使用的相機設置，和 GPS 資訊。 EXIF 標準包含了廣泛的元數據範疇，包含有關相機的技術資訊，例如型號、光圈、快門速度，和焦距。這些資訊對於想要審查特定照片的拍攝條件的攝影師來說極其有用。EXIF 數據也包含更詳細的標籤，像是閃光燈是否被使用、曝光模式、測光模式、白平衡設置，甚至還有鏡頭資訊。
EXIF 元數據也包含有關圖像本身的資訊，例如解析度、方向，以及圖片是否已經被修改。有些相機和智能手機也具有在 EXIF 數據中包含 GPS （全球定位系統）資訊的能力，記錄照片被拍攝的確切位置，這對於分類和編錄圖像很有用。
不過，需要注意的是，EXIF 數據可能對隱私構成風險，因為它可能會披露比預期更多的資訊給第三方。例如，公開帶有 GPS 位置數據的照片可能不經意地洩露自己的家庭地址或其他敏感地點。因為這個原因，許多社交媒體平台在圖像被上傳時會移除圖像的 EXIF 數據。然而，許多照片編輯和組織軟體給使用者檢視、編輯，或移除 EXIF 數據的選項。
EXIF 數據為攝影師和數位內容創作者提供了豐富的資訊來源，告知一張特定的照片是如何被拍攝的。不論是用於從拍攝情況中學習，從大量圖像集中分類查找，還是為實地工作提供準確的地理標籤，EXIF 數據都證實了其極大的價值。然而，分享包含 EXIF 數據的圖像時需要考慮到潛在的隱私問題。因此，了解如何管理這些數據在數位時代是一種重要的技能。
EXIF，或可交換圖像檔格式，數據包含一張照片的各種元數據，例如相機設置、照片拍攝的日期和時間，以及如果啟用了 GPS，可能還包含位置。
大多數圖像檢視器和編輯器（例如 Adobe Photoshop、Windows 照片檢視器等）都允許你 檢視 EXIF 數據。你只需要開啟屬性或資訊面板即可。
是的，EXIF 數據可以使用某些軟體程式編輯，像 Adobe Photoshop、Lightroom 或易於使用的線上資源。你可以使用這些工具調整或刪除特定的 EXIF 元數據欄位。
有。如果 GPS 啟用，嵌入 EXIF 元數據中的位置數據可能會外洩相片拍攝地點的敏感地理資訊。因此建議在分享照片時移除或曲解這些數據。
許多軟體程式允許你移除 EXIF 數據。這個過程通常被稱為 '剝除' EXIF 數據。也存在許多線上工具提供此功能。
為了維護用戶隱私，大多數社交媒體平台，如 Facebook、Instagram 和 Twitter，將自動剝除圖像的 EXIF 數據。
EXIF 數據可以包括相機模型、拍攝的日期與時間、焦距、曝光時間、光圈、ISO 設置、白平衡設置，和 GPS 位置等詳細資訊。
對攝影師而言，EXIF 數據可以幫助理解用於特定攝影作品的確切設置。這些資訊可以幫助在未來的拍攝中改善技術或複製類似的條件。
不，只有 在支援 EXIF 元數據的設備上拍攝的圖像，像數位相機和智能手機，會包含 EXIF 數據。
是的，EXIF 數據遵循由日本電子產業開發協會 (JEIDA) 設定的標準。然而，特定的製造商可能會包含額外的專屬資訊。
PDB(蛋白質數據庫)影像格式不是像 JPEG 或 PNG 那樣的傳統'影像'格式,而是一種儲存蛋白質、核酸和複合物三維結構資訊的數據格式。PDB 格式是生物資訊學和結構生物學的基石,因為它允許科學家可視化、共享和分析生物大分子的分子結構。PDB 檔案庫由全球蛋白質數據庫(wwPDB)管理,確保 PDB 數據可供全球社區自由公開使用。
PDB 格式最初於20世紀70年代初開發,以滿足對標準化分子結構表示方法的不斷增長需求。自那時以來,它已經演化以容納更廣泛的分子數據。該格式基於文本,可以被人類讀取,也可以由計算機處理。它由一系列記錄組成,每個記錄以六個字符的行標識符開頭,指定該記錄包含的資訊類型。這些記錄提供了關於結構的詳細描述,包括原子坐標、連接和實驗數據。
一個典型的 PDB 檔案以標頭部分開頭,其中包含有關蛋白質或核酸結構的元資料。此部分包含TITLE記錄(給出結構的簡要描述)、COMPND記錄(列出化學成分)和SOURCE記錄(描述生物分子的來源)等。標頭還包括AUTHOR記錄(列出確定結構的人員名稱)和JOURNAL記錄(提供結構首次描述的文獻引用)。
在標頭之後,PDB檔案包含宏分子主要序列資訊的SEQRES記 錄。這些記錄列出了分子鏈中出現的殘基(蛋白質的氨基酸,核酸的核苷酸)序列。這些資訊對於理解分子序列與其三維結構之間的關係至關重要。
ATOM記錄無疑是PDB檔案中最重要的部分,因為它們包含了分子中每個原子的坐標。每個ATOM記錄包括原子序號、原子名稱、殘基名稱、鏈標識符、殘基序號以及原子的x、y和z笛卡爾坐標(以埃為單位)。ATOM記錄允許重建分子的三維結構,這可以使用PyMOL、Chimera或VMD等專門軟體進行可視化。
除了ATOM記錄外,還有HETATM記錄用於非標準殘基或配體(如金屬離子、水分子或與蛋白質或核酸結合的其他小分子)的原子。這些記錄的格式與ATOM記錄類似,但被區分以facilitated 識別結構中的非巨大分子成分。
連接資訊在CONECT記錄中提供,這些記錄列出了原子之間的鍵合。這些記錄並非強制性的,因為大多數分子可視化和分析軟體都可以根據原子之間的距離推斷連接性。然而,它們對於定義不尋常的鍵合或具有金屬配位複合物的結構至關重要,因為從原子坐標單獨無法確定鍵合。
PDB格式還包括用於指定二級結構元素(如α-螺旋和β-折疊)的記錄。HELIX和SHEET記錄確定了這些結構,並提供了它們在序列中的位置資訊。這些資訊有助於理解大分子的摺疊模式,對於比較研究和建模至關重要。
用於確定結構的實驗數據和方法也記錄在PDB檔案中。EXPDTA記錄描述了實驗技術(如X射線晶體學、NMR光譜學),而REMARK記錄可包含關於結構的各種註釋和說明,包括數據採集、分辨率和精修統計等詳細資訊。
END記錄標誌著PDB檔案的結尾。值得注意的是,雖然PDB格式被廣泛使用,但由於其歷史悠久和固定欄寬格式,在處理擁有大量原子或需要更高精度的現代結構時可能會出現問題。為了解決這些限制,一種名為mmCIF(大分子晶體學資訊 檔案)的更新格式已被開發,它提供了一個更靈活和可擴展的框架來表示大分子結構。
儘管開發了mmCIF格式,但PDB格式仍然很受歡迎,因為它簡單,而且有大量的軟體工具支持它。研究人員通常根據需求和所使用的工具在PDB和mmCIF格式之間進行轉換。PDB格式的持久性證明了它在結構生物學領域的基礎性作用,以及它以相對簡單的方式傳達複雜結構資訊的有效性。
為了處理PDB檔案,科學家們使用各種計算工具。分子可視化軟體允許用戶載入PDB檔案並以三維方式查看結構,旋轉、放大和縮小,並應用不同的渲染樣式以更好地理解原子的空間排列。這些工具還通常提供其他功能,如測量距離、角度和二面角、模擬分子動力學,以及分析結構內部或與潛在配體的相互作用。
PDB格式在計算生物學和藥物發現中也發揮了關鍵作用。來自PDB檔案的結構資訊用於同源建模,即使用相關蛋白質的已知結構來預測感興趣蛋白質的結構。在基於結構的藥物設計中,目標蛋白質的PDB檔案用於篩選和優化潛在的藥物化合物,然後在實驗室中合成和測試這些化合物。
PDB格式的影響超出了個別研究項目。蛋白質數據庫本身是一個庫,目前包含超過150,000個結構,隨著新結構的確定和存放而不斷增長。這個數據庫是教育的寶貴資源,允許學生探索和學習生物大分子的結構。它也作為結構生物學在過去幾十年中取得進展的歷史記錄。
總之,PDB影像格式是結構生物學領域的關鍵工具,提供了一種存儲、共享和分析生物大分子三維結構的方法。雖然它有一些限制,但其廣泛的採用和豐富的工具生態系統確保它將在可預見的未來繼續發揮關鍵作用。隨著結構生物學領域的不斷發展,PDB格式很可能會被像mmCIF這樣更先進的格式所補充,但它作為現代結構生物學基礎的遺產將會永續 。
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